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银耳从接种到采收，全过程一般35-40天，但收成时遇阴雨天，可延长5天收割，待耳片完全展开，呈现出色白、半透明、柔软而富有弹性时为适采期。通常每朵直径达到15-20厘米，鲜重可达150-200克。此时不管朵子大小均要采摘。采收时间以上午为好，应从基部采收干净。采后及时摊于竹席等铺垫物上晾晒。
银耳贮藏适温为0℃，相对湿度95%以上为宜。适时通风换气，以免霉烂。银耳贮藏保鲜难度较大，即使在适宜的条件下，也仅能贮藏2周左右，故不宜久贮，只可周转运输性的短期保鲜贮藏。运输中应采用有衬垫物的筐和纸箱等包装物。
银耳的加工一般分2个步骤方法
1、晒干。此法简便易行。如遇晴天，将采下的银耳，剪除耳根，用清水漂洗干净，置于垫有干净纱布的竹筛上，在阳光下暴晒。注意勤翻动、小心操作、以防破损。一般天晴时有2天即可晒干。晒干品的含水量要比烤干略高些，不耐久藏，只适合小规模生产。
2、烘干。不受气候影响，可大量加工。烘房预热至40-45℃，将已整修、洗净的银耳送入烘房；始温为30℃，待耳片含水量降到30%左右后再使温度逐渐上升到50-60℃，焙烤6-10小时，当耳片接近干燥（耳基部未干透）时，再将温度降到30-40℃，直至烘干（含水量为10-13%）。如果采收是晴天，可先晒至半干后再行烘烤。晒与烘结合干制的银耳色泽好，香味浓郁。加工后立刻分级密封包装，贮于低温、干燥、通风处。随时注意检查，严防回潮、霉变或虫蛀。